表型检验融合行业偏爱的靶标为基础的方法，促成创意的化学生物学技术的发展，需要增进辨识新的化疗目标，加快药物的找到。一个化学基因组文库是一个选择性的小分子药物的子集，并从这样的人组看在表型检验否击中。这指出注解的目标，或药物的靶标有可能包括在于是以阻碍的可仔细观察到的表型中。

在2017年1月的NatureReviewsDrugDiscovery公开发表了一篇综述，文章中叙述的化学基因组带给的检验机会，大大减缓了表型检验项目转化成为药靶做到基础的药物找到方法。该综述对其它应用于也展开了辩论，还包括药物新的定位，预测毒理学和找到新的药理方式。化学基因组学经常出现在21世纪早期，是运用家族定向的化学文库展开细胞分析，加快药物的研发。

比如研发目标激酶的新抑制剂，可以用包括激酶抑制剂的文库接续展开检验，另外也可以用包括更加有可能与ATP融合位点融合的嘌呤类似物的小分子所建构的激酶为基础的文库接续。随着时间的流逝，现在化学基因组代表运用药理调节的所有基因产物，已发展沦为补足现有化学生物学的目标辨识技术。化学基因组文库检验的程序一个典型的化学基因组文库检验的程序如图所示：一个化学基因组学文库的表型检验（平行的计数检验或者更加普遍的细胞毒性和填充荧光）需要获取生物靶点。整个数据集的通路分析造成需要辨识特定候选化疗靶点的因果假设的产生，这必须用用于有序技术的实验来检验。

一些方法比如仅有基因组siRNA或CRISPR–Cas9检验需要平行继续执行加快靶标辨识。目标检验数据可以被用来完备计算机路径分析和产生新的假设。

最后，这些希望可能会造成调查的表型、新的化疗靶点或药物新的定位机会方面最重要的看法。简写：ABPP，活力为基础的蛋白传达序；CETSA，细胞热切换分析法；RNAi，RNA阻碍；shRNA，短发垫RNA阻碍。化学基因组文库检验子集的例子这篇文章所列了一些化学基因组文库的例子，并叙述了在表型检验中顺利用于这些子集必须留意的问题。一些化学基因组的文库早已在文献中被报导，虽然用作哪些化合物包括在子集中的自由选择标准的细节有时是缺少的，但是这些文库覆盖面积的基因家族和靶都展开了讲解。

作为结果这些文库之间的差异、它们潜在的优点和局限性是显著的。

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